Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms