Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf183Q8QZS5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf183Q8QZS5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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