Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28aQ8K3Y3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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