Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim68Q8K243 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trim68Q8K243 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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