Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp1Q8K021 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms