Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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