Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc28bQ8CEG5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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