Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lancl3Q8CD19 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lancl3Q8CD19 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lancl3Q8CD19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms