Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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