Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacnb2Q8CC27 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms