Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms