Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms