Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms