Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms