Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo38Q8BMI0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms