Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot10Q8BH15 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot10Q8BH15 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms