Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms