Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39bQ810L4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem39bQ810L4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms