Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otop3Q80UF9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms