Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja2Q80U04 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms