Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nek5Q7TSC3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms