Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Scn4bQ7M729 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn4bQ7M729 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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