Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eci3Q78JN3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Eci3Q78JN3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Eci3Q78JN3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms