Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed3Q78IS1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms