Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Atp8b3Q6UQ17 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atp8b3Q6UQ17 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp8b3Q6UQ17 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms