Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms