Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms