Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms