Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc148Q6P5U8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms