Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HelbQ6NVF4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms