Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt40Q6IFX3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms