Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tmcc1Q69ZZ6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tmcc1Q69ZZ6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tmcc1Q69ZZ6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmcc1Q69ZZ6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms