Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q66JV7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q66JV7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q66JV7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q66JV7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q66JV7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q66JV7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms