Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sf1Q64213 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sf1Q64213 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sf1Q64213 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf1Q64213 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms