Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vil1Q62468 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms