Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm5dQ62240 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm5dQ62240 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm5dQ62240 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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