Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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