Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprnQ60673 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms