Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CttnQ60598 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms