Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3aQ60520 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms