Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf84Q5VXU9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms