Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tns3Q5SSZ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tns3Q5SSZ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms