Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psme4Q5SSW2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psme4Q5SSW2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms