Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav8d-2Q5R1B6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav8d-2Q5R1B6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms