Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv4Q5R1A3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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