Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms