Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ecm2Q5FW85 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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