Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms