Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h12aQ5D1E7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms