Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CenpjQ569L8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpjQ569L8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms